Skinny Puppy נוסדה ב-Vancouver, British Columbia ב-1982 על ידי cEvin Key (Kevin Crompton) ו-Nivek Ogre (Kevin Ogilvie). השניים התחילו כניסוי אלקטרוני ביתי — Key על סינתסייזרים, Ogre על קול ותפירת אנימציה של הופעות. Dwayne Goettel הצטרף ב-1986 וחיזק את הצד האלקטרוני.
Nettwerk Records — לייבל קנדי עצמאי — חתם אותם. Remission (1984), Bites (1985), Mind: The Perpetual Intercourse (1986), Cleanse Fold and Manipulate (1987) — ארבעה אלבומים בארבע שנים. הופעות חיות של Skinny Puppy היו אירועי מולטי-מדיה: דם, חיות (לא אמיתיות), תפאורה אפוקליפטית. PETA ניסתה לחרם אותם.
Too Dark Park (1990) — Worlock, Tormentor. VIVIsectVI (1988) — Testure, כמחאה על ניסויים בחיות. ב-1995 Dwayne Goettel נפטר מ-overdose בגיל 31. הלהקה התפרקה.
ב-2000 ממשלת ארה"ב השתמשה בשיריהם לעינוי עצורים ב-Guantanamo ב-Abu Ghraib. Skinny Puppy שלחו חשבונית של 666,000 דולר לממשל אובמה — ב-2013. Key ו-Ogre חזרו ב-2000. עדיין פעילים.